要回答这个问题前，首先我们要知道胚胎发育的过程。
取卵当天，视为第0天，这天会完成卵子和精子的体外受精。受精后的第一天，会检视卵子是否成功受精，成功受精的胚胎接下来会进入分裂期，由2细胞，分裂成4细胞，8细胞，细胞数不断增加。 分裂期会进展到第三天，因此分裂期第三天前的胚胎型态主要会以细胞数多寡，细胞大小是否均匀和碎片多寡来评级。 受精后的第四天，胚胎进入桑椹胚期，这时候分裂的多个细胞形成团状。 接着，受精后的第五到七天，细胞团会分化成囊胚（blastocyst）。
第3天胚胎移植的主要优点：
有更多的胚胎可以转移。虽然胚胎在培养基中发育，但有些可能会在早期停止发育并变得无法生存。这就是为什么一些胚胎学家更喜欢第3天的转移，当胚胎有6到8个细胞时。总而言之，我们可以说第3天取消的风险低于培养延长至第5-6天的风险。此外，如果您希望将来使用它们，可用于冷冻的胚胎数量会更多一些。
第3天胚胎移植的缺点：用于植入前胚胎的形态学评分的不同方法不足以选择具有最大植入潜力的胚胎。
现在越来越多的生殖专家倾向移植第五天的囊胚，那么选择第五天的囊胚进行移植，第五天的囊胚究竟有哪些优势呢？
1、在自然受孕过程中，卵子受精后的第三天，胚胎还在输卵管内，而并未到达子宫，当胚胎发育成囊胚阶段时就会掉入子宫，进入到着床阶段。所以移植第五天的囊胚，可以更好地同步子宫环境，提高着床率。
2、90%以上的受精卵都会存活到第三天，但之后仅有50%的胚胎会继续生长到第五天，这部分衰退一方面取决于胚胎自身的质量，当然也取决于实验室的培养技术。
3、培养到第五天的囊胚可以进行植入前的全面染色体筛查（PGS）
移植染色体正确的胚胎将进一步提高移植的成功率，因此这项技术现在被越来越多的诊所所推荐。此项检查会将培养到第五天的囊胚中取出部分细胞进行活检，此阶段的囊胚已有一两百个细胞，核心细胞团（将来发育程成宝宝）和外表皮滋养层（将来发育成胎盘）已非常明显，此阶段进行染色体活检提取的是外表皮滋养层的细胞，对胚胎发育不会造成影响。而第三天的胚胎只有6-8个细胞，未达到高级阶段，在此阶段进行活检，可能会对整个胚胎的发育和活力产生影响。
第三天（分裂期）胚胎和第五天（囊胚期）胚胎 移植对比
| 第三天（分裂期）胚胎 | 第五天（囊胚期）胚胎 | |
| 无可植入胚胎风险 | 风险较低 | 风险较高 |
| 植入相同胚胎数 | 怀孕率较低 | 怀孕率较高 |
| 胚胎植入前染色体筛检 | 无法 | 可以 |
